Backtrace - was kann ich damit machen ?
Hi, bei der Installation einer Software (Gbrowse, ein Tool für BioInformatiker) mittels CPAN ist folgender Fehler aufgetreten: Error during installation of Gbrowse: "t/03.render.t ... 42/150 *** glibc detected *** /usr/bin/perl: corrupted double-linked list: 0x0000000004d11bc0 ***" Das ganze passierte in "make test". Außerdem habe ich noch einen backtrace bekommen (s.u.) Das ist jetzt das erste Mal, daß ich einen solchen backtrace bekomme. Was kann ich damit genau anfangen ? Wie könnte ich den Fehler einrgenzen ? Bernd t/03.render.t ............. 42/150 *** glibc detected *** /usr/bin/perl: corrupted double-linked list: 0x0000000004d11bc0 *** ======= Backtrace: ========= /lib64/libc.so.6[0x2b7dfdf0031e] /lib64/libc.so.6[0x2b7dfdf01bb7] /lib64/libc.so.6(__libc_free+0x6c)[0x2b7dfdf01d7c] /usr/bin/perl(Perl_sv_clear+0x781)[0x48ac91] /usr/bin/perl(Perl_sv_free+0x91)[0x48ae21] /usr/bin/perl(Perl_hv_free_ent+0x3c)[0x4763bc] /usr/bin/perl[0x476526] /usr/bin/perl(Perl_hv_undef+0x30)[0x4782d0] /usr/bin/perl(Perl_sv_clear+0x5e4)[0x48aaf4] /usr/bin/perl(Perl_sv_free+0x91)[0x48ae21] /usr/bin/perl(Perl_sv_clear+0x42d)[0x48a93d] /usr/bin/perl(Perl_sv_free+0x91)[0x48ae21] /usr/bin/perl(Perl_hv_free_ent+0x3c)[0x4763bc] /usr/bin/perl[0x476526] /usr/bin/perl(Perl_hv_undef+0x30)[0x4782d0] /usr/bin/perl(Perl_sv_clear+0x5e4)[0x48aaf4] /usr/bin/perl(Perl_sv_free+0x91)[0x48ae21] /usr/bin/perl(Perl_leave_scope+0xcfa)[0x4ad7fa] /usr/bin/perl(Perl_pp_return+0x39d)[0x4b82dd] /usr/bin/perl(Perl_runops_debug+0x11e)[0x46513e] /usr/bin/perl(perl_run+0x1a4)[0x4249c4] /usr/bin/perl(main+0xe4)[0x41d6c4] /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf4)[0x2b7dfdeb2184] /usr/bin/perl[0x41d549] ======= Memory map: ======== 00400000-00533000 r-xp 00000000 08:01 1756360 /usr/bin/perl 00632000-00639000 rw-p 00132000 08:01 1756360 /usr/bin/perl 00639000-04d32000 rw-p 00639000 00:00 0 [heap] 2b7dfd8cd000-2b7dfd8e8000 r-xp 00000000 08:01 1007619 /lib64/ld-2.4.so 2b7dfd8e8000-2b7dfd8e9000 rw-p 2b7dfd8e8000 00:00 0 2b7dfd904000-2b7dfd905000 rw-p 2b7dfd904000 00:00 0 2b7dfd905000-2b7dfd940000 r--p 00000000 08:01 738744 /usr/lib/locale/de_DE.utf8/LC_CTYPE 2b7dfd940000-2b7dfd947000 r--s 00000000 08:01 640784 /usr/lib64/gconv/gconv-modules.cache 2b7dfd947000-2b7dfd968000 rw-p 2b7dfd947000 00:00 0 2b7dfd9e7000-2b7dfd9e9000 rw-p 0001a000 08:01 1007619 /lib64/ld-2.4.so 2b7dfd9e9000-2b7dfda3d000 r-xp 00000000 08:01 1007688 /lib64/libm-2.4.so 2b7dfda3d000-2b7dfdb3c000 ---p 00054000 08:01 1007688 /lib64/libm-2.4.so 2b7dfdb3c000-2b7dfdb3e000 rw-p 00053000 08:01 1007688 /lib64/libm-2.4.so 2b7dfdb3e000-2b7dfdb40000 r-xp 00000000 08:01 1007686 /lib64/libdl-2.4.so 2b7dfdb40000-2b7dfdc40000 ---p 00002000 08:01 1007686 /lib64/libdl-2.4.so 2b7dfdc40000-2b7dfdc42000 rw-p 00002000 08:01 1007686 /lib64/libdl-2.4.so 2b7dfdc42000-2b7dfdc4b000 r-xp 00000000 08:01 1007684 /lib64/libcrypt-2.4.so 2b7dfdc4b000-2b7dfdd4a000 ---p 00009000 08:01 1007684 /lib64/libcrypt-2.4.so 2b7dfdd4a000-2b7dfdd4d000 rw-p 00008000 08:01 1007684 /lib64/libcrypt-2.4.so 2b7dfdd4d000-2b7dfdd7c000 rw-p 2b7dfdd4d000 00:00 0 2b7dfdd7c000-2b7dfdd90000 r-xp 00000000 08:01 1007706 /lib64/libpthread-2.4.so 2b7dfdd90000-2b7dfde8f000 ---p 00014000 08:01 1007706 /lib64/libpthread-2.4.so 2b7dfde8f000-2b7dfde91000 rw-p 00013000 08:01 1007706 /lib64/libpthread-2.4.so 2b7dfde91000-2b7dfde95000 rw-p 2b7dfde91000 00:00 0 2b7dfde95000-2b7dfdfcb000 r-xp 00000000 08:01 1007680 /lib64/libc-2.4.so 2b7dfdfcb000-2b7dfe0cb000 ---p 00136000 08:01 1007680 /lib64/libc-2.4.so 2b7dfe0cb000-2b7dfe0ce000 r--p 00136000 08:01 1007680 /lib64/libc-2.4.so 2b7dfe0ce000-2b7dfe0d0000 rw-p 00139000 08:01 1007680 /lib64/libc-2.4.so 2b7dfe0d0000-2b7dfe0d7000 rw-p 2b7dfe0d0000 00:00 0 2b7dfe0d7000-2b7dfe0da000 r-xp 00000000 08:01 936176 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Cwd/Cwd.so 2b7dfe0da000-2b7dfe1d9000 ---p 00003000 08:01 936176 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Cwd/Cwd.so 2b7dfe1d9000-2b7dfe1da000 rw-p 00002000 08:01 936176 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Cwd/Cwd.so 2b7dfe1da000-2b7dfe1e2000 r-xp 00000000 08:01 942100 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/List/Util/Util.so 2b7dfe1e2000-2b7dfe2e1000 ---p 00008000 08:01 942100 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/List/Util/Util.so 2b7dfe2e1000-2b7dfe2e2000 rw-p 00007000 08:01 942100 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/List/Util/Util.so 2b7dfe2e2000-2b7dfe2ea000 r-xp 00000000 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/usr/lib64/libjpeg.so.62.0.0 2b7dffbab000-2b7dffbac000 rw-p 00020000 08:01 640942 /usr/lib64/libjpeg.so.62.0.0 2b7dffbac000-2b7dffbe8000 r-xp 00000000 08:01 641125 /usr/lib64/libfontconfig.so.1.0.4 2b7dffbe8000-2b7dffce7000 ---p 0003c000 08:01 641125 /usr/lib64/libfontconfig.so.1.0.4 2b7dffce7000-2b7dffced000 rw-p 0003b000 08:01 641125 /usr/lib64/libfontconfig.so.1.0.4 2b7dffced000-2b7dffcef000 rw-p 2b7dffced000 00:00 0 2b7dffcef000-2b7dffd66000 r-xp 00000000 08:01 641028 /usr/lib64/libfreetype.so.6.3.8 2b7dffd66000-2b7dffe65000 ---p 00077000 08:01 641028 /usr/lib64/libfreetype.so.6.3.8 2b7dffe65000-2b7dffe6a000 rw-p 00076000 08:01 641028 /usr/lib64/libfreetype.so.6.3.8 2b7dffe6a000-2b7dffea5000 r-xp 00000000 08:01 640997 /usr/lib64/libpng12.so.0.1.2.8 2b7dffea5000-2b7dfffa5000 ---p 0003b000 08:01 640997 /usr/lib64/libpng12.so.0.1.2.8 2b7dfffa5000-2b7dfffa6000 rw-p 0003b000 08:01 640997 /usr/lib64/libpng12.so.0.1.2.8 2b7dfffa6000-2b7dfffc6000 r-xp 00000000 08:01 526974 /usr/lib64/libgd.so.2.0.0 2b7dfffc6000-2b7e000c5000 ---p 00020000 08:01 526974 /usr/lib64/libgd.so.2.0.0 2b7e000c5000-2b7e000e6000 rw-p 0001f000 08:01 526974 /usr/lib64/libgd.so.2.0.0 2b7e000e6000-2b7e000fa000 rw-p 2b7e000e6000 00:00 0 2b7e000fa000-2b7e0010a000 r-xp 00000000 08:01 1738881 /usr/X11R6/lib64/libXext.so.6.4 2b7e0010a000-2b7e0020a000 ---p 00010000 08:01 1738881 /usr/X11R6/lib64/libXext.so.6.4 2b7e0020a000-2b7e0020b000 rw-p 00010000 08:01 1738881 /usr/X11R6/lib64/libXext.so.6.4 2b7e0020b000-2b7e0022c000 r-xp 00000000 08:01 640792 /usr/lib64/libexpat.so.1.5.0 2b7e0022c000-2b7e0032b000 ---p 00021000 08:01 640792 /usr/lib64/libexpat.so.1.5.0 2b7e0032b000-2b7e0032e000 rw-p 00020000 08:01 640792 /usr/lib64/libexpat.so.1.5.0 2b7e0032e000-2b7e0033c000 r-xp 00000000 08:01 936182 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/DB_File/DB_File.so 2b7e0033c000-2b7e0043c000 ---p 0000e000 08:01 936182 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/DB_File/DB_File.so 2b7e0043c000-2b7e0043d000 rw-p 0000e000 08:01 936182 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/DB_File/DB_File.so 2b7e00458000-2b7e00548000 r-xp 00000000 08:01 641022 /usr/lib64/libdb-4.3.so 2b7e00548000-2b7e00647000 ---p 000f0000 08:01 641022 /usr/lib64/libdb-4.3.so 2b7e00647000-2b7e0064c000 rw-p 000ef000 08:01 641022 /usr/lib64/libdb-4.3.so 2b7e0064c000-2b7e00650000 r-xp 00000000 08:01 942105 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/MIME/Base64/Base64.so 2b7e00650000-2b7e0074f000 ---p 00004000 08:01 942105 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/MIME/Base64/Base64.so 2b7e0074f000-2b7e00750000 rw-p 00003000 08:01 942105 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/MIME/Base64/Base64.so 2b7e00750000-2b7e0075c000 r-xp 00000000 08:01 969328 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Digest/SHA/SHA.so 2b7e0075c000-2b7e0085b000 ---p 0000c000 08:01 969328 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Digest/SHA/SHA.so 2b7e0085b000-2b7e0085c000 rw-p 0000b000 08:01 969328 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Digest/SHA/SHA.so 2b7e0085c000-2b7e00862000 r-xp 00000000 08:01 871058 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Crypt/DH/GMP/GMP.so 2b7e00862000-2b7e00961000 ---p 00006000 08:01 871058 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Crypt/DH/GMP/GMP.so 2b7e00961000-2b7e00962000 rw-p 00005000 08:01 871058 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Crypt/DH/GMP/GMP.so 2b7e00962000-2b7e00999000 r-xp 00000000 08:01 641040 /usr/lib64/libgmp.so.3.3.3 2b7e00999000-2b7e00a99000 ---p 00037000 08:01 641040 /usr/lib64/libgmp.so.3.3.3 2b7e00a99000-2b7e00a9a000 rw-p 00037000 08:01 641040 /usr/lib64/libgmp.so.3.3.3 2b7e00a9a000-2b7e00aa6000 r-xp 00000000 08:01 969461 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/HTML/Parser/Parser.so 2b7e00aa6000-2b7e00ba5000 ---p 0000c000 08:01 969461 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/HTML/Parser/Parser.so 2b7e00ba5000-2b7e00ba6000 rw-p 0000b000 08:01 969461 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/HTML/Parser/Parser.so 2b7e00ba6000-2b7e00bce000 r-xp 00000000 08:01 969350 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Compress/Raw/Zlib/Zlib.so 2b7e00bce000-2b7e00ccd000 ---p 00028000 08:01 969350 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Compress/Raw/Zlib/Zlib.so 2b7e00ccd000-2b7e00cce000 rw-p 00027000 08:01 969350 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Compress/Raw/Zlib/Zlib.so 2b7e00cce000-2b7e00cd8000 r-xp 00000000 08:01 936231 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Encode/Encode.so 2b7e00cd8000-2b7e00dd7000 ---p 0000a000 08:01 936231 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Encode/Encode.so 2b7e00dd7000-2b7e00dd8000 rw-p 00009000 08:01 936231 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Encode/Encode.so 2b7e00dd8000-2b7e00df9000 rw-p 2b7e00dd8000 00:00 0 2b7e00df9000-2b7e00e2e000 r--s 00000000 08:01 1335499 /var/run/nscd/passwd 2b7e00e49000-2b7e00e50000 r-xp 00000000 08:01 1007693 /lib64/libnss_compat-2.4.so 2b7e00e50000-2b7e00f4f000 ---p 00007000 08:01 1007693 /lib64/libnss_compat-2.4.so 2b7e00f4f000-2b7e00f51000 rw-p 00006000 08:01 1007693 /lib64/libnss_compat-2.4.so 2b7e00f51000-2b7e00f5a000 r-xp 00000000 08:01 1007701 /lib64/libnss_nis-2.4.so 2b7e00f5a000-2b7e0105a000 ---p 00009000 08:01 1007701 /lib64/libnss_nis-2.4.so 2b7e0105a000-2b7e0105c000 rw-p 00009000 08:01 1007701 /lib64/libnss_nis-2.4.so 2b7e0105c000-2b7e01066000 r-xp 00000000 08:01 1007697 /lib64/libnss_files-2.4.so 2b7e01066000-2b7e01165000 ---p 0000a000 08:01 1007697 /lib64/libnss_files-2.4.so 2b7e01165000-2b7e01167000 rw-p 00009000 08:01 1007697 /lib64/libnss_files-2.4.so 2b7e01167000-2b7e0116d000 r-xp 00000000 08:01 942116 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Opcode/Opcode.so 2b7e0116d000-2b7e0126c000 ---p 00006000 08:01 942116 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Opcode/Opcode.so 2b7e0126c000-2b7e0126d000 rw-p 00005000 08:01 942116 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/Opcode/Opcode.so 2b7e0126d000-2b7e0128d000 r-xp 00000000 08:01 936169 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/B/B.so 2b7e0128d000-2b7e0138d000 ---p 00020000 08:01 936169 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/B/B.so 2b7e0138d000-2b7e0138e000 rw-p 00020000 08:01 936169 /usr/lib/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/B/B.so 2b7e0138e000-2b7e0139c000 r-xp 00000000 08:01 861422 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/FCGI/FCGI.so 2b7e0139c000-2b7e0149c000 ---p 0000e000 08:01 861422 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/FCGI/FCGI.so 2b7e0149c000-2b7e0149d000 rw-p 0000e000 08:01 861422 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/FCGI/FCGI.so 2b7e01500000-2b7e01521000 rw-p 2b7e01500000 00:00 0 2b7e01521000-2b7e01600000 ---p 2b7e01521000 00:00 0 2b7e01600000-2b7e0160d000 r-xp 00000000 08:01 1007734 /lib64/libgcc_s.so.1 2b7e0160d000-2b7e0170c000 ---p 0000d000 08:01 1007734 /lib64/libgcc_s.so.1 2b7e0170c000-2b7e0170d000 rw-p 0000c000 08:01 1007734 /lib64/libgcc_s.so.1 7fffad1c8000-7fffad1dd000 rw-p 7fffad1c8000 00:00 0 [stack] ffffffffff600000-ffffffffffe00000 ---p 00000000 00:00 0 [vdso] -- Bernd Lentes Systemadministration Institut für Entwicklungsgenetik HelmholtzZentrum münchen bernd.lentes@helmholtz-muenchen.de phone: +49 89 3187 1241 fax: +49 89 3187 3826 http://www.helmholtz-muenchen.de/idg Wer Visionen hat, soll zum Hausarzt gehen Helmut Schmidt Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Ingolstädter Landstr. 1 85764 Neuherberg www.helmholtz-muenchen.de Aufsichtsratsvorsitzende: MinDir´in Bärbel Brumme-Bothe Geschäftsführer: Prof. Dr. Günther Wess und Dr. Nikolaus Blum Registergericht: Amtsgericht München HRB 6466 USt-IdNr: DE 129521671 -- Um die Liste abzubestellen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+unsubscribe@opensuse.org Um den Listen Administrator zu erreichen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+owner@opensuse.org
Am Mon, 27 Feb 2012 11:29:52 +0100 schrieb "Lentes, Bernd" <bernd.lentes@helmholtz-muenchen.de>:
Hi,
bei der Installation einer Software (Gbrowse, ein Tool für BioInformatiker) mittels CPAN ist folgender Fehler aufgetreten: Error during installation of Gbrowse: "t/03.render.t ... 42/150 *** glibc detected *** /usr/bin/perl: corrupted double-linked list: 0x0000000004d11bc0 ***" [...] 1007734 /lib64/libgcc_s.so.1 2b7e0160d000-2b7e0170c000 ---p 0000d000 08:01 1007734 /lib64/libgcc_s.so.1 2b7e0170c000-2b7e0170d000 rw-p 0000c000 08:01 1007734 /lib64/libgcc_s.so.1 7fffad1c8000-7fffad1dd000 rw-p 7fffad1c8000 00:00 0 [stack] ffffffffff600000-ffffffffffe00000 ---p 00000000 00:00 0 [vdso]
Hast du mehrere Versionen von gcc und glibc installiert? Es scheint das ldd eine /lib64libgcc_s.so.1 mehrfach linked. -Dieter -- Dieter Klünter | Systemberatung http://dkluenter.de GPG Key ID:DA147B05 53°37'09,95"N 10°08'02,42"E -- Um die Liste abzubestellen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+unsubscribe@opensuse.org Um den Listen Administrator zu erreichen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+owner@opensuse.org
Dieter schrieb:
Hi,
bei der Installation einer Software (Gbrowse, ein Tool für BioInformatiker) mittels CPAN ist folgender Fehler aufgetreten: Error during installation of Gbrowse: "t/03.render.t ... 42/150 *** glibc detected *** /usr/bin/perl: corrupted double-linked list: 0x0000000004d11bc0 ***" [...] 1007734 /lib64/libgcc_s.so.1 2b7e0160d000-2b7e0170c000 ---p 0000d000 08:01 1007734 /lib64/libgcc_s.so.1 2b7e0170c000-2b7e0170d000 rw-p 0000c000 08:01 1007734 /lib64/libgcc_s.so.1 7fffad1c8000-7fffad1dd000 rw-p 7fffad1c8000 00:00 0 [stack] ffffffffff600000-ffffffffffe00000 ---p 00000000 00:00 0 [vdso]
Hast du mehrere Versionen von gcc und glibc installiert? Es scheint das ldd eine /lib64libgcc_s.so.1 mehrfach linked.
Hi, das sagt rpm: pc53200:~ # rpm -qa|grep -i gcc libgcc-4.1.2_20070115-0.32.53 gcc-c++-4.1.2_20070115-0.32.53 gcc-4.1.2_20070115-0.32.53 pc53200:~ # rpm -qa|grep -i glibc glibc-devel-2.4-31.97.1 glibc-2.4-31.97.1 glibc-i18ndata-2.4-31.97.1 glibc-locale-2.4-31.97.1 glibc-32bit-2.4-31.97.1 glibc-locale-32bit-2.4-31.97.1 Sieht m.E. nicht so aus, als ob etwas doppelt installiert ist. Oder interpretierst Du das Erscheinen von gcc und gcc-c++ als mehrfach (sind doch unterschiedliche Compiler) ? Bernd P.S. Sorry für PM Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Ingolstädter Landstr. 1 85764 Neuherberg www.helmholtz-muenchen.de Aufsichtsratsvorsitzende: MinDir´in Bärbel Brumme-Bothe Geschäftsführer: Prof. Dr. Günther Wess und Dr. Nikolaus Blum Registergericht: Amtsgericht München HRB 6466 USt-IdNr: DE 129521671 -- Um die Liste abzubestellen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+unsubscribe@opensuse.org Um den Listen Administrator zu erreichen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+owner@opensuse.org
Am Mon, 27 Feb 2012 13:36:27 +0100 schrieb "Lentes, Bernd" <bernd.lentes@helmholtz-muenchen.de>:
Dieter schrieb:
Hi,
bei der Installation einer Software (Gbrowse, ein Tool für BioInformatiker) mittels CPAN ist folgender Fehler aufgetreten: Error during installation of Gbrowse: "t/03.render.t ... 42/150 *** glibc detected *** /usr/bin/perl: corrupted double-linked
[...]
das sagt rpm:
pc53200:~ # rpm -qa|grep -i gcc libgcc-4.1.2_20070115-0.32.53 gcc-c++-4.1.2_20070115-0.32.53 gcc-4.1.2_20070115-0.32.53
pc53200:~ # rpm -qa|grep -i glibc glibc-devel-2.4-31.97.1 glibc-2.4-31.97.1 glibc-i18ndata-2.4-31.97.1 glibc-locale-2.4-31.97.1 glibc-32bit-2.4-31.97.1 glibc-locale-32bit-2.4-31.97.1
Sieht m.E. nicht so aus, als ob etwas doppelt installiert ist. Oder interpretierst Du das Erscheinen von gcc und gcc-c++ als mehrfach (sind doch unterschiedliche Compiler) ?
OK, scheint nichts in mehreren Minor-Versionen vorhanden zu sein. Sicherheitshalber kannst du mal mit ldd /usr/bin/gcc und ldd /usr/bin/perl prüfen. gcc ist die Gnu Compiler Collection, g++ ist die C++ Variation, daher sind dies auch unterschiedliche Pakete. -Dieter -- Dieter Klünter | Systemberatung http://dkluenter.de GPG Key ID:DA147B05 53°37'09,95"N 10°08'02,42"E -- Um die Liste abzubestellen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+unsubscribe@opensuse.org Um den Listen Administrator zu erreichen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+owner@opensuse.org
Hi, Dieter schrieb:
[...]
das sagt rpm:
pc53200:~ # rpm -qa|grep -i gcc libgcc-4.1.2_20070115-0.32.53 gcc-c++-4.1.2_20070115-0.32.53 gcc-4.1.2_20070115-0.32.53
pc53200:~ # rpm -qa|grep -i glibc glibc-devel-2.4-31.97.1 glibc-2.4-31.97.1 glibc-i18ndata-2.4-31.97.1 glibc-locale-2.4-31.97.1 glibc-32bit-2.4-31.97.1 glibc-locale-32bit-2.4-31.97.1
Sieht m.E. nicht so aus, als ob etwas doppelt installiert ist. Oder interpretierst Du das Erscheinen von gcc und gcc-c++ als mehrfach (sind doch unterschiedliche Compiler) ?
OK, scheint nichts in mehreren Minor-Versionen vorhanden zu sein. Sicherheitshalber kannst du mal mit ldd /usr/bin/gcc und ldd /usr/bin/perl prüfen.
So, endlich komme ich dazu, mich diesem Problem zu widmen. Ich habe das betr. System als VM geklont, damit ich jetzt das Problem in aller Ruhe nachvollziehen kann, ohne das Echtsystem zu stören. Der Backtrace ist wieder an der gleichen Stelle aufgetreten. Wie von Dir gewünscht: vm53200-15:~ # ldd /usr/bin/gcc libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x00002af3e5515000) /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00002af3e53f9000) vm53200-15:~ # vm53200-15:~ # ldd /usr/bin/perl libm.so.6 => /lib64/libm.so.6 (0x00002b25fba2b000) libdl.so.2 => /lib64/libdl.so.2 (0x00002b25fbb80000) libcrypt.so.1 => /lib64/libcrypt.so.1 (0x00002b25fbc84000) libpthread.so.0 => /lib64/libpthread.so.0 (0x00002b25fbdbe000) libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x00002b25fbed7000) /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00002b25fb90f000) Was sagt mir das jetzt ? Bernd Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Ingolstädter Landstr. 1 85764 Neuherberg www.helmholtz-muenchen.de Aufsichtsratsvorsitzende: MinDir´in Bärbel Brumme-Bothe Geschäftsführer: Prof. Dr. Günther Wess und Dr. Nikolaus Blum Registergericht: Amtsgericht München HRB 6466 USt-IdNr: DE 129521671 -- Um die Liste abzubestellen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+unsubscribe@opensuse.org Um den Listen Administrator zu erreichen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+owner@opensuse.org
On Mon, Feb 27, 2012 at 11:29:52AM +0100, Lentes, Bernd wrote:
Hi,
bei der Installation einer Software (Gbrowse, ein Tool für BioInformatiker) mittels CPAN ist folgender Fehler aufgetreten: Error during installation of Gbrowse: "t/03.render.t ... 42/150 *** glibc detected *** /usr/bin/perl: corrupted double-linked list: 0x0000000004d11bc0 ***"
Das ganze passierte in "make test". Außerdem habe ich noch einen backtrace bekommen (s.u.)
Das ist jetzt das erste Mal, daß ich einen solchen backtrace bekomme. Was kann ich damit genau anfangen ? Wie könnte ich den Fehler einrgenzen ?
Im gdb starten und da den backtrace aufnehmen. Es scheint sich um eine Memory corruption zu handeln. Insofern kannst du auch mal "valgrind" auf diesen speziellen Testcase probieren. Ciao, Marcus -- Um die Liste abzubestellen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+unsubscribe@opensuse.org Um den Listen Administrator zu erreichen, schicken Sie eine Mail an: opensuse-de+owner@opensuse.org
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