Administratorpasswort funktioniert nicht bei allen Anwendungen

Guten Tag, auf unserem Server läuft SLES 9. Auf den Konsolen 1-6 kann ich mich als root mit dem entsprechenden Passwort anmelden. Bei der Ausführung von Programmen die root Rechte benötigen gibt es auf den Textkonsolen keine Schwierigkeiten. Wenn ich jedoch auf dem kde-Desktop yast oder ein root-Konsolenfenster starte und nach der Abfrage das root Passwort eingebe wird es nicht akzeptiert. Kann mir jemand die grobe Richtung nennen in die ich zur Problemlösung bewegen soll. Ich bin zwar kein Linux Profi, habe aber schon ein paar Erfahrungen mit Linux gemacht. Danke für die Hilfe.