Confirgurar puerto serial

Hola Soy nuevo en el sitio y espero poder ayudar y obtener información acerca de Linux Suse. Tengo una aplicacion en java que me lee y escribe puertos tipo COM1. La aplicacion corre perfecto con Widows y Linux RedHat, pero intento correrla en Linux Suse 9.1 y no obtengo respuesta del puerto. El dispositivo que estoy usando es el /dev/ttyS0 y lo configuro con "stty". Alguien conoce como puede configurar este tipo de puerto en este Linux Gracias Martin Munera