Lío con UTF-8 y codificaciones

Hola, cuando descargo un disco con emule, al descomprimir (o el mismo archivo comprimido) si tiene acentos se ven dos cuadritos, lo que quiere decir que no los reconoce, y con firefox, poara subirlos, por ejemplo, dice que no existe, creo que es problema de la codificación (al disco de windows FAT32 tambiñen tengo que modificarle los nombres con acentos para que se vean bien). Exactamente, sabéis cuál es el problema? Y la solución? Gracias y saludos!