combinacion de C y Bash

Hola, recientemente presenté mi proyecto 'Vileda' programado en bash de linux (sh). La ultima version que he sacado es la 0.1c y aunque con torpezas va realizando sus funciones: limpiar el hd. Bueno, ahora estoy trabajando la version 0.2 donde el cambio mas notable es pasar el codigo bash a C standard. Mi pregunta es la siguiente: ¿Hsay alguna forma de indicarle al codigo que ciertas sentencias están escritas en bash para que C lo respete? Conocemos la sentencia: system ("comando"); pero para segun que variables, pasar sus valores acarrean ciertos incovenientes. Gracias por adelantado. Salu2 y paz