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[Marco Roeben <roeben@xxxxxxxxxxxxx>]

Hallo Bernd,

danke für Deine Anregungen!


Am Dienstag, 29. März 2011, 11:44:11 schrieb Lentes, Bernd:

> wenn Du einen reibungsfreien Betrieb sicherstellen willst, schlage ich
> folgendes vor:
>
> - USV (kostet nicht mehr die Welt)
> - backup (wo speichern die Leute die Ergebnisse ihrer Brechnungen ?). Ein
> backup ist m.E. sehr wichtig ! Was wäre, wenn die Ergebnisse weg wären ?

Die Rechnungen laufen auf dem Rechner und die Ergebnisse werden dann auf die 
entsprechenden Arbeitsplatzrechner der Benutzer kopiert. Diese wiederrum 
liegen auf einem zentralen Server der entsprechend redundant ist und 
regelmäßig gebackupt wird.

Falls der Rechner ausfällt ist es zwar unschön, aber nicht so tragisch.


> - Wenn Du RAID1 per Hardwarecontroller löst, haben diese oft eine
> Weboberfläche, um sich den Status des Controllers anzusehen, und ggf. auch
> im Fehlerfall eine email zu schicken. Hardware-RAID ist aber nicht
> unbedingt nötig und macht die Sache auch teuerer.

Ist im Budget nicht drinne.


> - Wenn die Kiste
> hochverfügbar sein soll, denk über redundante Netzteile (Netzteile gehen
> gerne mal kaputt), ggf. auch redundante Netzwerkkarten nach.
> Netzwerkkarten im bonding macht die Sache natürlich komplizierter.

Wie oben schon erläutert ist das nicht nötig. Langfristig (so in einem Jahr) 
wird der Rechner von einem "richtigen" Server der von der IT beschafft und 
dann auch verwaltet wird abgelöst.


> - Ich geh mal
> davon aus, daß Rosetta ziemlich rechenintensiv ist. Denk also über mehrere
> CPU's, auch mit mehreren Cores, nach.

Server ist für den Rechner vielleicht etwas hoch gegriffen, aber im Hinblick 
darauf, dass langfristig sowieso ein professionelles System angeschafft wird 
und jetzt erstmal schnell etwas angeschafft werden muss um die Rechnungen 
laufen zu lassen um keinen Stillstand zu haben ist die Konfiguration eher im 
oberen Preisniveau eines Desktoprechners angesiedelt.

Hexacore i7, 24 GB RAM, 120GB SSD fürs System und 1 TB Raid1 für die Daten, 
als Grafikkarte eine NVIDIA GT450 (um die Möglichkeite zu haben CUDA zu 
benutzen).

Sobald der Server hier im Haus steht (im Moment werden erstmal Angebote 
reingeholt und Anschaffungen im öffentlichen Dienst dauern wenn mehr als 100k 
Euro ausgegeben werden) wird dies der Desktoprechner unseres Chefs. Wir können 
jetzt arbeiten und unser Chef hat danach einen schönen Desktop-Rechner. Also 
eine win-win-Sitauation. :-)


> - was meisnt Du mit
> "wissenschaftliche Programmen für die Berechnung von Moledynamiken" ?

XPLOR-NIH, CNS, TALOS, CYANA, ARIA, etc.


> Prüf mal, ob eines dieser Programme CUDA unterstützt. Damit könntest Du
> Berechnungen auf die Grafikkarte auslagern, was die Sache u.U. sehr
> beschleinigt. 

Siehe oben. :-)


> - Wenn die Kiste länger im Betrieb sein soll, denk
> darüber nach, SLES statt OpenSuSE zu kaufen. Dies wird länger als die
> OpenSuSE-Produkte gepflegt.

Wie schon erwähnt. Erstmal ist eine Laufzeit des Computers als "Rechenknecht" 
für max. 1 Jahr angedacht.
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