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Quelltext, configure und make.

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Wie bringe ich yast/rpm nun bei, das alles i.O. ist?

Soweit ich weiß gar nicht, da deine Software nicht in die rpm-DB eingetragen wurde! Welche Susi verwendest du nochmal? bei der 8.2er kannste dem Yast mitteilen dass er bestimmte Pakete nie installieren soll, vielleicht hilft das als kleiner Workaround.

P.S.: das ändert aber nichts an deiner Inkonsistenten (uff was für n Wort) rpm-Datenbank